基因型鉴定的方法有哪些？很多网友在网上发帖询问基因鉴定的常规方法有哪些。在选择基因型鉴定之前，要时刻了解基因型鉴定，这是合理的。今天我们来看看基因型鉴定的方法。

基因型鉴定的方法是什么？

1.第二代测序IGV观察/callSNP软件分析

原理：设计各种标签序列(F方向和R方向)的组合，使不同的组合对应不同的样本。根据测序导出reads上的标签序列，区分测序结果中的样本。一个测序可以获得多个样本数据，测序信息量不需要太高，可以是1-2G，然后突变类型和纯杂合可以根据测序结果与参考序列的匹配情况和reads的比例来判断；

优点：通量大，单个样品成本低，可以识别单个位点存在的各种突变类型；

缺陷：结果反馈速度慢，一般需要两个星期左右才能得到结果，不适合检查样本量。

2.DSDEcodeM分析第一代测序文件的测序文件。

原理：软件根据测序信号峰值双峰嵌套位置和强度来判断突变类型；

优点：速度快，第一代测序结果一般可以在第二天得到，软件分析速度快；

缺点:单个样本成本高，不适合大样本量检验。当位点有两种以上的突变类型时，测序峰值混乱，手动和软件无法很好的区分。

3.KASP

原理：用不同的荧光标记不同的引物(两个引物的尾部有一个SNP变异)，PCR延伸后会传出不同的闪光，基因型是根据闪光值来判断的；

优点：检测速度快(扩展时间短)，通量大(一次96板QPCR仪)；

缺陷：试剂成本高，仪器设备昂贵，仅适用于检测单位点SNP变异，序列变异情况不明确，适用范围窄。

4.dCAPs

原理:在已知序列变异的情况下，利用突变形成的酶切位点对突变位点的PCR扩张产品进行酶切检测，突变情况根据酶切结果进行判断。

优点：成本低(单个样本只需要0.1ul酶)，通量大(可以同时检测出大量类似突变的样本)，周期短(PCR扩张增加酶切割后电泳一天即可完成)。；

缺陷：在选择合适的内切酶之前，需要对突变位点进行序列状态，有些内切酶可能并不常见。

5.SSR分析

原理：基因型根据杂带大小的不同进行分析；

优点：检测速度快，通量大，可检测1bp长度差(建议3bp以上)；

缺陷：试剂成本较高(使用专业分析仪)，仅用于检测已知碱基缺失的突变位置。

基因型鉴定的原理

人类基因组的一部分是22对常染色体和1对性染色体(包括1个X染色体和1个Y染色体)。DNA碱基对31.6亿个，由DNA和核糖蛋白组成。单核苷酸多态性是指单核苷酸的多态性，也称为SNP。它是一种具有相同碱基的单核苷酸，对人体的遗传特性有一定的影响。

当前，人体DNA的大部分差异都是SNP上的差异。这一差异约为人体DNA碱基总量的0.5%。现在，SNP的研究报告很大一部分是基于SNP的。